El Programa de Investigación del CIDIAT se orienta a generar, innovar y adaptar los conocimientos que se requieren para llevar a cabo los planes, programas y proyectos que adelantan los organismos del sector público en materia de aprovechamiento sustentable del agua, la tierra, los recursos naturales asociados y el manejo del medio ambiente; para ello, el Centro canaliza su acción hacia sus áreas prioritarias de actuación. El programa está directamente relacionado con los Estudios de postgrado a nivel de maestría que adelanta el CIDIAT y se define en función de las demandas tecnológicas que identifican las sucesivas etapas previstas en las diferentes categorías programáticas a base de las cuales se organiza la acción de gobierno, tratando de abordar problemas específicos de importancia local, nacional, regional e internacional. Estos problemas tienen características especiales, dado que constituyen esfuerzos conceptuales y de planteo teórico, así como en lo que respecta a la producción de modelos, procedimientos y métodos; además, abarca temas regionales que son comunes a extensas áreas de los ecosistemas tropicales y andinos de Venezuela en particular y de América Latina y el Caribe en general.